Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx11Q6AXC6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx11Q6AXC6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ddx11Q6AXC6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx11Q6AXC6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx11Q6AXC6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx11Q6AXC6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms