Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rftn1Q6A0D4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn1Q6A0D4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.6 ms