Protein–RNA interactions for Protein: Q64151

Sema4c, Semaphorin-4C, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4cQ64151 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4cQ64151 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4cQ64151 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4cQ64151 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms