Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab34Q64008 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab34Q64008 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab34Q64008 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab34Q64008 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms