Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddr2Q62371 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr2Q62371 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms