Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Ttf1Q62187 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf1Q62187 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Ttf1Q62187 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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Ttf1Q62187 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms