Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprrQ62132 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprrQ62132 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprrQ62132 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprrQ62132 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms