Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt33bQ61897 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt33bQ61897 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt33bQ61897 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms