Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rai1Q61818 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rai1Q61818 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rai1Q61818 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rai1Q61818 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rai1Q61818 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rai1Q61818 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rai1Q61818 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rai1Q61818 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rai1Q61818 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rai1Q61818 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rai1Q61818 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rai1Q61818 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rai1Q61818 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai1Q61818 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms