Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd1Q61466 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd1Q61466 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd1Q61466 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms