Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lcp1Q61233 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcp1Q61233 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms