Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Astn1Q61137 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Astn1Q61137 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Astn1Q61137 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms