Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cln3Q61124 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cln3Q61124 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cln3Q61124 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms