Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf8Q60846 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms