Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HnrnpdQ60668 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HnrnpdQ60668 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms