Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm11487Q5RIS0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm11487Q5RIS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms