Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mdc1Q5PSV9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mdc1Q5PSV9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms