Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rapgef6Q5NCJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rapgef6Q5NCJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms