Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc1Q5NCF2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms