Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm3Q5F4S9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm3Q5F4S9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms