Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf2Q59J78 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf2Q59J78 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf2Q59J78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms