Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf608Q56A10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Znf608Q56A10 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Znf608Q56A10 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf608Q56A10 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms