Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Srrm1Q52KI8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm1Q52KI8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms