Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccnl1Q52KE7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccnl1Q52KE7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccnl1Q52KE7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccnl1Q52KE7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccnl1Q52KE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccnl1Q52KE7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccnl1Q52KE7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccnl1Q52KE7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccnl1Q52KE7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms