Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf38aQ4FK66 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf38aQ4FK66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf38aQ4FK66 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms