Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shank3Q4ACU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shank3Q4ACU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shank3Q4ACU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms