Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg1lQ3V384 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg1lQ3V384 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms