Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Esf1Q3V1V3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Esf1Q3V1V3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Esf1Q3V1V3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Esf1Q3V1V3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Esf1Q3V1V3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Esf1Q3V1V3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms