Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prdm6Q3UZD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm6Q3UZD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm6Q3UZD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm6Q3UZD5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms