Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3UPC7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3UPC7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q3UPC7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UPC7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UPC7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UPC7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UPC7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Q3UPC7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms