Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rmdn3Q3UJU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rmdn3Q3UJU9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms