Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Babam1Q3UI43 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Babam1Q3UI43 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Babam1Q3UI43 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms