Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnrc6cQ3UHC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6cQ3UHC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnrc6cQ3UHC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms