Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp36Q3UFY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.3 ms