Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Puf60Q3UEB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Puf60Q3UEB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Puf60Q3UEB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Puf60Q3UEB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms