Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T9

Dennd1b, DENN domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd1bQ3U1T9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dennd1bQ3U1T9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dennd1bQ3U1T9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dennd1bQ3U1T9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dennd1bQ3U1T9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms