Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hhla1Q3TYV2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hhla1Q3TYV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms