Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms