Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CiartQ3TQ03 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CiartQ3TQ03 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms