Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc2Q3TLP5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Echdc2Q3TLP5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms