Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdlim7Q3TJD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdlim7Q3TJD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms