Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEL6

Rnf157, E3 ubiquitin ligase Rnf157, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf157Q3TEL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf157Q3TEL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf157Q3TEL6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf157Q3TEL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf157Q3TEL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms