Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RubcnlQ3TD16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RubcnlQ3TD16 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RubcnlQ3TD16 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms