Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem104Q3TB48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem104Q3TB48 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem104Q3TB48 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem104Q3TB48 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem104Q3TB48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms