Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNM2

March5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March5Q3KNM2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March5Q3KNM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March5Q3KNM2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
March5Q3KNM2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March5Q3KNM2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms