Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4dQ2MDG0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4dQ2MDG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4dQ2MDG0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4dQ2MDG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4dQ2MDG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4dQ2MDG0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox4dQ2MDG0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox4dQ2MDG0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms