Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ptchd1Q14B62 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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ptchd1Q14B62 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ptchd1Q14B62 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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