Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ptchd1Q14B62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ptchd1Q14B62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms