Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zc3h18Q0P678 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms