Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lrriq1Q0P5X1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lrriq1Q0P5X1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrriq1Q0P5X1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms