Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbp2Q08652 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms